Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D2P62837 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms