Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S1P61966 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S1P61966 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S1P61966 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms