Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRPS1P60891 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPS1P60891 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms