Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB15P59190 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB15P59190 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB15P59190 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB15P59190 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB15P59190 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB15P59190 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB15P59190 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB15P59190 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB15P59190 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB15P59190 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB15P59190 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB15P59190 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB15P59190 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB15P59190 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB15P59190 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB15P59190 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB15P59190 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB15P59190 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB15P59190 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB15P59190 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB15P59190 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB15P59190 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB15P59190 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB15P59190 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB15P59190 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB15P59190 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB15P59190 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB15P59190 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB15P59190 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB15P59190 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB15P59190 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB15P59190 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB15P59190 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB15P59190 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB15P59190 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB15P59190 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB15P59190 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB15P59190 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB15P59190 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB15P59190 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB15P59190 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB15P59190 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms