Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms