Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EEFSECP57772 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms