Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN8P56748 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms