Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME5P56597 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME5P56597 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME5P56597 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME5P56597 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME5P56597 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME5P56597 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME5P56597 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NME5P56597 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NME5P56597 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NME5P56597 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME5P56597 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME5P56597 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME5P56597 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NME5P56597 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME5P56597 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NME5P56597 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME5P56597 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME5P56597 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME5P56597 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME5P56597 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME5P56597 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME5P56597 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME5P56597 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME5P56597 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME5P56597 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NME5P56597 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME5P56597 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME5P56597 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME5P56597 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME5P56597 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME5P56597 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME5P56597 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME5P56597 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME5P56597 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME5P56597 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME5P56597 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME5P56597 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME5P56597 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NME5P56597 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME5P56597 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms