Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHBP55084 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHBP55084 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHBP55084 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHBP55084 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHBP55084 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHBP55084 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHBP55084 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHBP55084 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHBP55084 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHBP55084 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHBP55084 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHBP55084 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHBP55084 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHBP55084 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHBP55084 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHBP55084 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHBP55084 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHBP55084 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHBP55084 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHBP55084 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHBP55084 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHBP55084 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHBP55084 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHBP55084 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHBP55084 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHBP55084 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HADHBP55084 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HADHBP55084 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
HADHBP55084 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HADHBP55084 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHBP55084 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHBP55084 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHBP55084 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHBP55084 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHBP55084 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHBP55084 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHBP55084 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHBP55084 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHBP55084 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHBP55084 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHBP55084 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHBP55084 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHBP55084 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHBP55084 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHBP55084 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHBP55084 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHBP55084 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHBP55084 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHBP55084 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHBP55084 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHBP55084 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHBP55084 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHBP55084 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHBP55084 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHBP55084 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHBP55084 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHBP55084 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHBP55084 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHBP55084 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHBP55084 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHBP55084 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHBP55084 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HADHBP55084 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HADHBP55084 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HADHBP55084 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HADHBP55084 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HADHBP55084 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHBP55084 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHBP55084 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHBP55084 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHBP55084 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHBP55084 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHBP55084 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHBP55084 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHBP55084 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms