Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A2P55011 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC12A2P55011 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms