Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN5P54829 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms