Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHB1P54762 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms