Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB3P54284 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms