Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P54278 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P54278 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PMS2P54278 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P54278 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P54278 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P54278 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P54278 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P54278 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P54278 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P54278 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P54278 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P54278 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P54278 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P54278 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P54278 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P54278 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P54278 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P54278 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P54278 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P54278 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P54278 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P54278 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P54278 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P54278 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms