Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMTNP53814 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMTNP53814 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMTNP53814 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMTNP53814 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMTNP53814 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMTNP53814 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMTNP53814 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMTNP53814 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMTNP53814 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMTNP53814 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMTNP53814 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMTNP53814 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMTNP53814 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMTNP53814 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMTNP53814 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMTNP53814 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMTNP53814 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMTNP53814 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMTNP53814 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMTNP53814 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMTNP53814 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMTNP53814 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMTNP53814 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMTNP53814 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMTNP53814 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMTNP53814 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMTNP53814 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMTNP53814 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMTNP53814 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMTNP53814 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMTNP53814 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMTNP53814 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMTNP53814 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMTNP53814 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMTNP53814 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMTNP53814 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMTNP53814 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMTNP53814 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMTNP53814 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMTNP53814 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMTNP53814 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMTNP53814 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMTNP53814 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMTNP53814 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMTNP53814 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMTNP53814 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMTNP53814 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMTNP53814 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMTNP53814 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMTNP53814 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMTNP53814 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMTNP53814 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNP53814 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNP53814 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNP53814 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNP53814 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNP53814 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNP53814 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNP53814 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNP53814 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMTNP53814 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNP53814 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNP53814 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNP53814 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNP53814 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNP53814 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNP53814 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNP53814 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNP53814 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNP53814 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNP53814 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMTNP53814 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms