Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NKX2-5P52952 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms