Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP98P52948 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP98P52948 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP98P52948 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP98P52948 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP98P52948 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP98P52948 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP98P52948 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP98P52948 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP98P52948 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP98P52948 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP98P52948 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP98P52948 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP98P52948 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP98P52948 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP98P52948 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP98P52948 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP98P52948 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP98P52948 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP98P52948 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP98P52948 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP98P52948 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP98P52948 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP98P52948 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP98P52948 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP98P52948 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP98P52948 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP98P52948 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP98P52948 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP98P52948 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP98P52948 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP98P52948 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP98P52948 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP98P52948 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP98P52948 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP98P52948 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP98P52948 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP98P52948 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP98P52948 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP98P52948 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP98P52948 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP98P52948 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP98P52948 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP98P52948 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP98P52948 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP98P52948 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP98P52948 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP98P52948 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP98P52948 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP98P52948 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP98P52948 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP98P52948 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP98P52948 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP98P52948 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP98P52948 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP98P52948 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP98P52948 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP98P52948 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP98P52948 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP98P52948 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP98P52948 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP98P52948 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP98P52948 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP98P52948 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP98P52948 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP98P52948 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP98P52948 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP98P52948 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP98P52948 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP98P52948 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP98P52948 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms