Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF140P52738 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms