Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2A2P52657 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms