Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms