Protein–RNA interactions for Protein: P51814

ZNF41, Zinc finger protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF41P51814 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF41P51814 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF41P51814 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms