Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLCNKBP51801 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms