Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB28P51157 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB28P51157 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB28P51157 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB28P51157 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB28P51157 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB28P51157 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB28P51157 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB28P51157 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB28P51157 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB28P51157 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB28P51157 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB28P51157 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB28P51157 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB28P51157 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB28P51157 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB28P51157 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB28P51157 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB28P51157 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB28P51157 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB28P51157 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB28P51157 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB28P51157 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB28P51157 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB28P51157 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB28P51157 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB28P51157 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB28P51157 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB28P51157 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms