Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK7P50613 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK7P50613 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK7P50613 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK7P50613 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK7P50613 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK7P50613 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK7P50613 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK7P50613 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK7P50613 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK7P50613 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK7P50613 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK7P50613 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK7P50613 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK7P50613 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK7P50613 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK7P50613 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK7P50613 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK7P50613 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK7P50613 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK7P50613 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK7P50613 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK7P50613 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK7P50613 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK7P50613 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK7P50613 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK7P50613 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK7P50613 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK7P50613 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK7P50613 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK7P50613 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK7P50613 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK7P50613 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK7P50613 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK7P50613 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK7P50613 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK7P50613 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK7P50613 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK7P50613 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK7P50613 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK7P50613 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK7P50613 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK7P50613 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK7P50613 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK7P50613 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK7P50613 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK7P50613 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK7P50613 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK7P50613 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK7P50613 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK7P50613 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK7P50613 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK7P50613 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK7P50613 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK7P50613 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK7P50613 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK7P50613 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK7P50613 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK7P50613 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK7P50613 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK7P50613 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK7P50613 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK7P50613 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK7P50613 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK7P50613 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK7P50613 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK7P50613 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK7P50613 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK7P50613 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK7P50613 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK7P50613 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK7P50613 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK7P50613 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK7P50613 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK7P50613 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK7P50613 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK7P50613 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK7P50613 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK7P50613 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK7P50613 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK7P50613 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK7P50613 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms