Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSRP3P50461 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSRP3P50461 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms