Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK2P49760 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK2P49760 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK2P49760 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK2P49760 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK2P49760 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK2P49760 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK2P49760 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK2P49760 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK2P49760 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK2P49760 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK2P49760 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK2P49760 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK2P49760 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK2P49760 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK2P49760 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK2P49760 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK2P49760 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK2P49760 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK2P49760 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK2P49760 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLK2P49760 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLK2P49760 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLK2P49760 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLK2P49760 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLK2P49760 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLK2P49760 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLK2P49760 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLK2P49760 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLK2P49760 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLK2P49760 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLK2P49760 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLK2P49760 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLK2P49760 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK2P49760 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK2P49760 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK2P49760 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK2P49760 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK2P49760 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK2P49760 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK2P49760 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK2P49760 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK2P49760 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK2P49760 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK2P49760 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK2P49760 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK2P49760 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK2P49760 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK2P49760 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK2P49760 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK2P49760 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK2P49760 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK2P49760 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK2P49760 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK2P49760 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK2P49760 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK2P49760 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK2P49760 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK2P49760 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK2P49760 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK2P49760 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK2P49760 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK2P49760 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLK2P49760 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLK2P49760 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLK2P49760 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLK2P49760 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK2P49760 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLK2P49760 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLK2P49760 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLK2P49760 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLK2P49760 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLK2P49760 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLK2P49760 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLK2P49760 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLK2P49760 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLK2P49760 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLK2P49760 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLK2P49760 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms