Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXA1P49639 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms