Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNTBP49356 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNTBP49356 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNTBP49356 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTBP49356 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTBP49356 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTBP49356 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTBP49356 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTBP49356 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTBP49356 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTBP49356 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTBP49356 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNTBP49356 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNTBP49356 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTBP49356 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTBP49356 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTBP49356 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTBP49356 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNTBP49356 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTBP49356 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTBP49356 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTBP49356 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTBP49356 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTBP49356 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTBP49356 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTBP49356 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTBP49356 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTBP49356 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNTBP49356 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNTBP49356 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNTBP49356 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNTBP49356 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTBP49356 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTBP49356 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTBP49356 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTBP49356 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTBP49356 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTBP49356 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms