Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMTP48728 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMTP48728 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMTP48728 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMTP48728 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AMTP48728 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AMTP48728 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AMTP48728 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms