Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA8P48165 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA8P48165 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA8P48165 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA8P48165 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA8P48165 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA8P48165 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA8P48165 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA8P48165 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA8P48165 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA8P48165 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA8P48165 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA8P48165 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA8P48165 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA8P48165 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA8P48165 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA8P48165 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA8P48165 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA8P48165 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA8P48165 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA8P48165 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA8P48165 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA8P48165 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA8P48165 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA8P48165 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJA8P48165 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA8P48165 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA8P48165 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA8P48165 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA8P48165 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA8P48165 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA8P48165 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA8P48165 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA8P48165 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA8P48165 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA8P48165 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA8P48165 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA8P48165 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA8P48165 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA8P48165 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA8P48165 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA8P48165 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA8P48165 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA8P48165 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA8P48165 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA8P48165 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA8P48165 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA8P48165 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA8P48165 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA8P48165 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA8P48165 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA8P48165 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA8P48165 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA8P48165 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA8P48165 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA8P48165 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA8P48165 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA8P48165 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA8P48165 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA8P48165 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA8P48165 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA8P48165 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA8P48165 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA8P48165 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA8P48165 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA8P48165 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA8P48165 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA8P48165 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA8P48165 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA8P48165 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA8P48165 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA8P48165 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA8P48165 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA8P48165 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA8P48165 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA8P48165 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA8P48165 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA8P48165 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms