Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPTX2P47972 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPTX2P47972 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPTX2P47972 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms