Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP5P45974 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP5P45974 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP5P45974 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP5P45974 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP5P45974 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP5P45974 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP5P45974 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP5P45974 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP5P45974 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP5P45974 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP5P45974 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP5P45974 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP5P45974 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP5P45974 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP5P45974 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP5P45974 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP5P45974 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP5P45974 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP5P45974 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP5P45974 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP5P45974 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP5P45974 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP5P45974 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP5P45974 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP5P45974 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP5P45974 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP5P45974 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP5P45974 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP5P45974 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP5P45974 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP5P45974 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP5P45974 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP5P45974 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP5P45974 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP5P45974 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP5P45974 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP5P45974 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP5P45974 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP5P45974 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP5P45974 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP5P45974 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP5P45974 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP5P45974 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP5P45974 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP5P45974 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP5P45974 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP5P45974 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP5P45974 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP5P45974 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP5P45974 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP5P45974 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP5P45974 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP5P45974 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP5P45974 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP5P45974 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP5P45974 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP5P45974 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP5P45974 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP5P45974 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP5P45974 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP5P45974 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP5P45974 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP5P45974 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP5P45974 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP5P45974 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP5P45974 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP5P45974 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP5P45974 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP5P45974 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP5P45974 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP5P45974 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP5P45974 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP5P45974 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP5P45974 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP5P45974 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP5P45974 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP5P45974 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP5P45974 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP5P45974 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP5P45974 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP5P45974 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP5P45974 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP5P45974 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP5P45974 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP5P45974 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP5P45974 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms