Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCAMP43121 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCAMP43121 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCAMP43121 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCAMP43121 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MCAMP43121 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCAMP43121 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCAMP43121 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCAMP43121 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCAMP43121 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCAMP43121 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCAMP43121 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCAMP43121 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCAMP43121 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCAMP43121 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MCAMP43121 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MCAMP43121 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCAMP43121 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MCAMP43121 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCAMP43121 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MCAMP43121 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCAMP43121 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCAMP43121 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCAMP43121 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCAMP43121 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCAMP43121 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCAMP43121 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCAMP43121 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCAMP43121 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCAMP43121 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MCAMP43121 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCAMP43121 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCAMP43121 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCAMP43121 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCAMP43121 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCAMP43121 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCAMP43121 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCAMP43121 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCAMP43121 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCAMP43121 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCAMP43121 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCAMP43121 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MCAMP43121 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCAMP43121 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCAMP43121 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCAMP43121 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCAMP43121 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCAMP43121 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCAMP43121 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCAMP43121 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCAMP43121 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCAMP43121 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCAMP43121 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCAMP43121 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MCAMP43121 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCAMP43121 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCAMP43121 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCAMP43121 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCAMP43121 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCAMP43121 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCAMP43121 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCAMP43121 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCAMP43121 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCAMP43121 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCAMP43121 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCAMP43121 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCAMP43121 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCAMP43121 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCAMP43121 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms