Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGDSP41222 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGDSP41222 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms