Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHAP40939 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHAP40939 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHAP40939 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHAP40939 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHAP40939 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHAP40939 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHAP40939 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHAP40939 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHAP40939 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HADHAP40939 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HADHAP40939 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HADHAP40939 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HADHAP40939 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HADHAP40939 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HADHAP40939 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HADHAP40939 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HADHAP40939 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHAP40939 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHAP40939 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHAP40939 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHAP40939 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHAP40939 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHAP40939 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHAP40939 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HADHAP40939 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHAP40939 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHAP40939 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHAP40939 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHAP40939 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHAP40939 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHAP40939 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHAP40939 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHAP40939 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHAP40939 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHAP40939 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HADHAP40939 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HADHAP40939 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HADHAP40939 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HADHAP40939 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HADHAP40939 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHAP40939 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHAP40939 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHAP40939 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHAP40939 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHAP40939 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHAP40939 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHAP40939 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHAP40939 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HADHAP40939 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms