Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX19P40855 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX19P40855 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX19P40855 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX19P40855 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX19P40855 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX19P40855 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX19P40855 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX19P40855 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX19P40855 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX19P40855 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX19P40855 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX19P40855 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX19P40855 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX19P40855 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PEX19P40855 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX19P40855 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX19P40855 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX19P40855 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX19P40855 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX19P40855 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX19P40855 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX19P40855 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX19P40855 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX19P40855 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX19P40855 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX19P40855 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX19P40855 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX19P40855 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX19P40855 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX19P40855 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX19P40855 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX19P40855 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX19P40855 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX19P40855 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX19P40855 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX19P40855 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX19P40855 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX19P40855 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX19P40855 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX19P40855 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX19P40855 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX19P40855 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX19P40855 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX19P40855 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms