Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX2P40425 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX2P40425 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX2P40425 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX2P40425 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX2P40425 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX2P40425 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX2P40425 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX2P40425 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX2P40425 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX2P40425 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX2P40425 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX2P40425 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX2P40425 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX2P40425 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX2P40425 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX2P40425 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX2P40425 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX2P40425 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX2P40425 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX2P40425 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX2P40425 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX2P40425 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX2P40425 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX2P40425 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX2P40425 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX2P40425 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX2P40425 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX2P40425 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX2P40425 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX2P40425 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX2P40425 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX2P40425 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX2P40425 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX2P40425 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX2P40425 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX2P40425 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX2P40425 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX2P40425 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX2P40425 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX2P40425 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX2P40425 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX2P40425 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX2P40425 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX2P40425 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX2P40425 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX2P40425 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX2P40425 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX2P40425 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX2P40425 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX2P40425 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX2P40425 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX2P40425 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX2P40425 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX2P40425 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX2P40425 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX2P40425 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX2P40425 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX2P40425 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX2P40425 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX2P40425 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX2P40425 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX2P40425 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX2P40425 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX2P40425 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX2P40425 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms