Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VHLP40337 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VHLP40337 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VHLP40337 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VHLP40337 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VHLP40337 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VHLP40337 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VHLP40337 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VHLP40337 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VHLP40337 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VHLP40337 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VHLP40337 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VHLP40337 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VHLP40337 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VHLP40337 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VHLP40337 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VHLP40337 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VHLP40337 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VHLP40337 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VHLP40337 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VHLP40337 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VHLP40337 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VHLP40337 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VHLP40337 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VHLP40337 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VHLP40337 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VHLP40337 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VHLP40337 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VHLP40337 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VHLP40337 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VHLP40337 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VHLP40337 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VHLP40337 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VHLP40337 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VHLP40337 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VHLP40337 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VHLP40337 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VHLP40337 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VHLP40337 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VHLP40337 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VHLP40337 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VHLP40337 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VHLP40337 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VHLP40337 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VHLP40337 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VHLP40337 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VHLP40337 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VHLP40337 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VHLP40337 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VHLP40337 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VHLP40337 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VHLP40337 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VHLP40337 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VHLP40337 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms