Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACVRL1P37023 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACVRL1P37023 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVRL1P37023 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms