Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA7P36544 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms