Protein–RNA interactions for Protein: P36075

CUE2, Ubiquitin-binding protein CUE2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE2P36075 CNS1YBR155W 1158 nt4.91□□□□□ -1.62
CUE2P36075 CLA4YNL298W 2529 nt4.91□□□□□ -1.62
CUE2P36075 ATG18YFR021W 1503 nt4.91□□□□□ -1.62
CUE2P36075 SRO9YCL037C 1305 nt4.91□□□□□ -1.62
CUE2P36075 MSE1YOL033W 1611 nt4.9□□□□□ -1.62
CUE2P36075 SUR2YDR297W 1050 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 CNL1YDR357C 369 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 ACT1YFL039C 1128 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YHB1YGR234W 1200 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 CUP1-1YHR053C 186 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 CUP1-2YHR055C 186 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YJL215CYJL215C 360 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YKL123WYKL123W 381 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 RPC25YKL144C 639 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 RCN1YKL159C 636 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 TRS33YOR115C 807 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 MED4YOR174W 855 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 UBA3YPR066W 900 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YPR109WYPR109W 885 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 PWR1PWR1 941 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YAP1YML007W 1953 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 ADE6YGR061C 4077 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 PRT1YOR361C 2292 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YTA6YPL074W 2265 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 GCN5YGR252W 1320 nt4.9□□□□□ -1.63
CUE2P36075 MAK11YKL021C 1407 nt4.89□□□□□ -1.63
CUE2P36075 IRC22YEL001C 678 nt4.89□□□□□ -1.63
CUE2P36075 SKI8YGL213C 1194 nt4.89□□□□□ -1.63
CUE2P36075 RMR1YGL250W 726 nt4.89□□□□□ -1.63
CUE2P36075 RPI1YIL119C 1224 nt4.89□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt4.89□□□□□ -1.63
CUE2P36075 REH1YLR387C 1299 nt4.89□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YBL029WYBL029W 1131 nt4.89□□□□□ -1.63
CUE2P36075 DLT1YMR126C 1029 nt4.89□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YOR152CYOR152C 771 nt4.89□□□□□ -1.63
CUE2P36075 DBP5YOR046C 1449 nt4.89□□□□□ -1.63
CUE2P36075 PTR2YKR093W 1806 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 CLN2YPL256C 1638 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 snR63snR63 255 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 PTC1YDL006W 846 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YKL023WYKL023W 834 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 POM33YLL023C 840 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 SMD3YLR147C 306 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 SAS5YOR213C 747 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 MGE1YOR232W 687 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 SIS2YKR072C 1689 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 CLF1YLR117C 2064 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 ASA1YPR085C 1332 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 MPH2YDL247W 1830 nt4.88□□□□□ -1.63
CUE2P36075 ATG1YGL180W 2694 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 PGM2YMR105C 1710 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 HRK1YOR267C 2280 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YDL124WYDL124W 939 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 GIM4YEL003W 336 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 CPR7YJR032W 1182 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 SRP21YKL122C 504 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YKL169CYKL169C 384 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 NYV1YLR093C 762 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YAR061WYAR061W 204 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YNL050CYNL050C 813 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 FDH1YOR388C 1131 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YBR053CYBR053C 1077 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 RSA1YPL193W 1146 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 snR19snR19 568 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 IMD3YLR432W 1572 nt4.87□□□□□ -1.63
CUE2P36075 NSE4YDL105W 1209 nt4.86□□□□□ -1.63
CUE2P36075 NRG1YDR043C 696 nt4.86□□□□□ -1.63
CUE2P36075 BMH1YER177W 804 nt4.86□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YLR225CYLR225C 1224 nt4.86□□□□□ -1.63
CUE2P36075 RPC19YNL113W 429 nt4.86□□□□□ -1.63
CUE2P36075 MAP2YBL091C 1266 nt4.86□□□□□ -1.63
CUE2P36075 TPT1YOL102C 693 nt4.86□□□□□ -1.63
CUE2P36075 SNF8YPL002C 702 nt4.86□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YBR063CYBR063C 1215 nt4.86□□□□□ -1.63
CUE2P36075 CEG1YGL130W 1380 nt4.86□□□□□ -1.63
CUE2P36075 RAD16YBR114W 2373 nt4.86□□□□□ -1.63
CUE2P36075 HMLALPHA1YCL066W 528 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 MATALPHA1YCR040W 528 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 ATC1YDR184C 885 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 RNH202YDR279W 1053 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 ZRT1YGL255W 1131 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 BTN2YGR142W 1233 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 EFM4YIL064W 774 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 FMP33YJL161W 543 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 MBR1YKL093W 1020 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YPR147CYPR147C 915 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 UMP1YBR173C 447 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YMR102CYMR102C 2505 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 SKG3YLR187W 3081 nt4.85□□□□□ -1.63
CUE2P36075 MPS3YJL019W 2049 nt4.84□□□□□ -1.63
CUE2P36075 MOT2YER068W 1764 nt4.84□□□□□ -1.63
CUE2P36075 VPS36YLR417W 1701 nt4.84□□□□□ -1.63
CUE2P36075 TIM54YJL054W 1437 nt4.84□□□□□ -1.63
CUE2P36075 CTF13YMR094W 1437 nt4.84□□□□□ -1.63
CUE2P36075 MNN10YDR245W 1182 nt4.84□□□□□ -1.63
CUE2P36075 IRC7YFR055W 1023 nt4.84□□□□□ -1.63
CUE2P36075 YGR153WYGR153W 654 nt4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.7 ms