Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HNF1BP35680 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms