Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXD13P35453 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms