Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM5P33992 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM5P33992 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM5P33992 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM5P33992 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM5P33992 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM5P33992 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM5P33992 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM5P33992 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM5P33992 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM5P33992 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM5P33992 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM5P33992 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM5P33992 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM5P33992 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM5P33992 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM5P33992 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM5P33992 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM5P33992 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM5P33992 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM5P33992 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM5P33992 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM5P33992 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM5P33992 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM5P33992 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM5P33992 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM5P33992 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM5P33992 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM5P33992 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM5P33992 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM5P33992 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM5P33992 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM5P33992 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM5P33992 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM5P33992 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM5P33992 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM5P33992 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM5P33992 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM5P33992 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MCM5P33992 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM5P33992 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM5P33992 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM5P33992 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM5P33992 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM5P33992 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM5P33992 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM5P33992 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM5P33992 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM5P33992 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM5P33992 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM5P33992 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM5P33992 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM5P33992 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM5P33992 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM5P33992 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM5P33992 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM5P33992 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM5P33992 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM5P33992 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM5P33992 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM5P33992 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM5P33992 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM5P33992 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM5P33992 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM5P33992 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM5P33992 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM5P33992 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM5P33992 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM5P33992 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM5P33992 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM5P33992 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM5P33992 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM5P33992 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCM5P33992 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms