Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1CAMP32004 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms