Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A4P31645 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A4P31645 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A4P31645 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A4P31645 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC6A4P31645 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A4P31645 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms