Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM4SF1P30408 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms