Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCSK1P29120 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK1P29120 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms