Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF2E2P29084 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms