Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
PTPRMP28827 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRMP28827 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
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